Genel Bilgi Konu Başlıkları Yeterlilik İlişkisi Değerlendirme Sistemi Öğrenme Çıktıları Özgü Ölçüt Matrisi

Hafta	Teori Konu Başlıkları
1	Fungus genetiği ile ilgili temel kavramlar
2	Moleküler yöntemlerin çeşitleri (Kültüre dayalı ve kültür bağımsız yöntemler, DNA ve RNA tabanlı yöntemler)
3	Moleküler yöntemlerin çeşitleri II
4	DNA izolasyon yöntemleri (Saf kültürden, çevresel ve/veya karışık örnekten)
5	DNA görüntüleme yöntemleri
6	Polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) ve temel bileşenleri
7	Ara sınav
8	Ara sınav
9	Primer seçimi ve önemi
10	PCR ürünlerinin temizlenmesi, dizi analizi ve değerlendirmesi
11	PCR bağımlı moleküler yöntemler (DGGE vb.)
12	PCR'dan bağımsız yöntemler (FISH vb.)
13	PCR bağımlı ve bağımsız moleküler yöntemlerin avantaj ve dezavantajlarının karşılaştırılması
14	Konu ile ilgili güncel literatürlerin incelenmesi ve değerlendirilmesi

Hafta	Uygulama Konu Başlıkları
1	Deneyin planlanması, gerekli besiyeri ve sarf malzemelerin steril edilmesi
2	Primerlerin seçimi ve sulandırılması, dNTP mix ve TAE tamponunun hazırlanması
3	Stok kültürün canlandırılması ve sterilite kontrolü
4	Saf fungus kültürünün ekimi ve inkübasyonu
5	Taze kültüründen DNA izolasyonu
6	%1 agaroz hazırlanması ve agaroz jel eElektroforezi yöntemi ile izole edilen DNA'nın yürütülmesi ,UV translüminatörde izole edilen DNA'nın görüntülenmesi ve değerlendirme
7	Ara sınav
8	Ara sınav
9	Polimeraz zincir reaksiyonu ile hedef DNA bölgesinin çoğaltılması
10	%1 agaroz hazırlanması ve agaroz jel elektroforezi yöntemi ile izole edilen DNA'nın yürütülmesi ,UV translüminatörde izole edilen DNA'nın görüntülenmesi ve marker ile kıyaslanması
11	PCR ürünlerinin saflaştırılması ve dizi analizi
12	Sekanslanan dizilerin NCBI veri bankasına girişi ve sonuçların karşılaştırılması, değerlendirme
13	Tanımlanan fungusun güncel isimlendirilmesi ve kontrolü için Index Fungorum web sitesinin kullanımı
14	Değerlendirme