BİYOENFORMATİK YÖNTEMLER II

İzlence Konu Başlık

Hafta Teori Konu Başlıkları
1 Genomik Veri Tipleri
2 Genom Dizileme Teknolojilerine Giriş
3 Genomik Varyasyonlar I: SNP ve INDELs
4 Genomik Varyasyonlar II: Kopya Sayı Değişimleri ve Yapısal Varyasyonlar
5 Transkriptom Veri Analizi
6 Gen İfade Analizleri I : Transkript İfadesi
7 Arasınav
8 Gen İfade Analizleri II: Kümeleme Yöntemleri
9 Transkriptom Annotasyonu I: Gen Ontoloji ve Yolak Analizi
10 Transkriptom Annotasyonu II: Gen Seti Zenginleştirme Analizi
11 Cis-Trans Düzenleyici Sistemler
12 Protein Yapı, Motif ve Etkileşimleri
Hafta Uygulama Konu Başlıkları
1 Genomik Dosya sistemleri Uygulama ve Veri görselleştirme
2 DNA Dizileme Teknolojileri Sistemlerine Bakış
3 Tek nokta polimorfizmi ve Insersiyon/Delesyon Uygulamaları
4 Kopya Sayı Değişimleri, Inversiyon, Translokasyon, Duplikasyon, Segmental Duplikasyon Uygulamaları
5 Referans Temelli ve De novo Transkript Oluşturma Uygulamaları
6 Transkirpt Gen İfade Analizi Uygulamaları
7 Arasınav
8 Gen ifadesine Dayalı Transkript Kümeleme Yöntemi Uygulamaları
9 Gene Ontoloji ve KEGG/Reactome Uygulamaları
10 İşlevsel Zenginleştirme Analizleri, GSEA Uygulamaları
11 Kodlanmayan Cis, Trans Bölgelerinin Tespiti
12 Protein İkincil Yapılarının ve Etkileşimleri Uygulamaları

Bilgi İşlem Daire Başkanlığı © 2024