Genel Bilgi Konu Başlıkları Yeterlilik İlişkisi Değerlendirme Sistemi Öğrenme Çıktıları Özgü Ölçüt Matrisi

Hafta	Teori Konu Başlıkları
1	Moleküler Veri Tipleri
2	Biyolojik Veri Tabanlarına Giriş: DNA/RNA Veri Tabanları
3	Biyolojik Veri Tabanlarına Giriş: Protein Veri Tabanları
4	DNA Dizi Analiz Yöntemleri
5	Dizi Hizalama Yöntemleri: İkili Dizi Hizalama
6	Dizi Hizalama Yöntemleri: Çoklu Dizi Hizalama
7	Arasınav
8	NCBI-BLAST Yöntemi I
9	NCBI-BLAST Yöntemi II
10	DNA ve Protein Motif Belirleme
11	Filogenetik: Temel Analiz Yöntemleri
12	Filogenetik-Model Seçimi

Hafta	Uygulama Konu Başlıkları
1	Deneysel sonuçlardan elde edilen ve biyoinformatik için gerekli veri tiplerinin (örneğin; fasta, fastq, bam, sam, vcf) uygulamalı gösterimi
2	Moleküler Biyolojide yoğun olarak kullanılan ana/ikincil/öznel nükleik asit veri tabanları uygulaması
3	Moleküler Biyolojide yoğun olarak kullanılan ana/ikincil/öznel protein veri tabanları uygulaması
4	DNA Dizileme Yöntem ve Araçlarının Tanıtılması
5	Nükleik Asit ve Protein İkili Dizi Hizalama Uygulaması
6	Nükleik Asit ve Protein Çoklu Dizi Hizalama Uygulaması
7	Arasınav
8	Temel Blast Uygulamaları (BlastN, BlastP, BlastX, tBlastN, tBlastX)
9	İleri Blast Uygulamaları (MEGABLAST, PSI-BLAST, PHI-BLAST)
10	HMMER Uygulamaları
11	Filogenetik ağaç topolojisi, UPGMA, Neighbor-Joining, Maximum Parsimony, Maximum Likelihood, Bayesian Filogenetik Yaklaşımlar ve Uygulamaları
12	Nükleik Asit ve Protein dizileri ile filogenetik model oluşturma ve seçimi