Genel Bilgi Konu Başlıkları Yeterlilik İlişkisi Değerlendirme Sistemi Öğrenme Çıktıları Özgü Ölçüt Matrisi

Hafta	Teori Konu Başlıkları
1	R Programlama Diline Giriş
2	R Dilinde Temel Komutlar ve Paketler
3	R Veri Yapısı, Veri Dönüşümü, Veri Okuma-Yazma
4	Bioconductor Paketlerine Giriş
5	Biyolojik Veri Tabanları ve Veri Çağırma
6	AraSınav
7	AraSınav
8	DNA Dizi Analiz ve Manipülasyonları
9	DNA ve Protein Motif ve Domainleri
10	Filogenetik Analiz: Filogenetik Algoritmalara Giriş, Model Seçimi ve Ağaçlar
11	Gen İfadesinin Belirlenmesi ve Analiz Uygulamaları
12	Gen Ontoloji ve Metabolik Yolak Analizleri
13	Genom Annotasyonu
14	Genom Varyant Çağırma ve Analizi

Hafta	Uygulama Konu Başlıkları
1	R ve Rstudio programı indirme, yükleme-kurulum ve temel özellikler
2	R'da tanımlı hazır veri setleri ile pratik
3	R'da tanımlı hazır veri setleri ile pratik
4	Bioconductor Kurulumu ve Bioconductor Paketleri ile Temel Uygulamalar
5	R ile Çeşitli Veri Tabanlarından genomik, transkriptomik, proteomik: biomaRt
6	AraSınav
7	AraSınav
8	İkili ve Çoklu Dizi Hizalama Pratikleri
9	HMMER ile Motif Analizi ve Transkripsiyon Faktör Bağlanma Bölgelerinin Tespiti
10	Model Seçimi, Filogenetik Ağaç Oluşturma, Görselleştirme ve Manipülasyonu
11	R ile Farklı İfade Edilen Genlerin Tespiti: Transkriptom Analiz Uygulamaları
12	R ile Gene Ontoloji ve KEGG Metabolik Yolak Analizi
13	R ile Genome Annotations
14	R ile Genom Varyant Analiz Uygulamaları