Su ürünleri yetiştiricilik alanında sorunların çözümüne bilimsel bakış açısı getirmek, ülke ekonomisine katkıda bulunan bireyler yetiştirmek
Su ürünlerinin üretiminden hasatına kadar tüm aşamalarında çok yönlü bilimsel araştırmalar yoluyla modern ve yeni teknolojileri kullanmak. Günümüz teknolojilerini ülkemiz koşullarına adapte etmek böylece bilim dünyasına ve sektöre öncülük etmektir. Uluslararası standartlarda düşünmeye ve erdelemeye yatkın donanımlı lisansüstü düzeyde eğitim vermektir.
İstanbul Üniversitesi Lisansüstü Eğitim ve Öğretim Yönetmeliğine göre; ALES veya eşdeğeri sınav notu, yabancı dil notu, lisans ve yüksek lisans dersleri not ortalaması ve mülâkat sonuçları, Yönetmelikte belirtilen asgari notlardan az olmamak üzere ilgili enstitü yönetim kurulunun teklifi ve Senato kararıyla belirlenir.