| Ders Adı | BIOINFORMATICS | Kod | MOBG4129 |
| Kredi | 3 | AKTS | 5 |
| Z/S | Seçmeli | Teorik Saat | 3 |
| Uygulama Saat | 0 | Lab Saat | 0 |
| Ders Dili | Türkçe | Dersi Veren | Dr. Ögr. Üyesi KEMAL ŞANLI |
| Dersin Veriliş Türü | |||
Dersin amacı Moleküler Biyoloji ve Genetik lisans programı öğrencilerine biyoinformatiği ve biyoinformatik alanındaki temel yöntemleri tanıtmaktır.
Bu ders Moleküler Biyoloji ve Genetik lisans programı öğrencilerine biyoinformatik biliminin temel yöntemlerini gelişen Yeni Nesil Dizileme teknolojilerinden elde edilen verilerin analizine olanak sağlayacak şekilde öğretmektedir.
- Ders müfredatı ve öğrenme çıktıları öğrencilere anlatılır. - Ders sunumları ve interaktif uygulamalarla etkin eğitim ve öğretim koşulları sağlanır. - Öğrenciler grup proje ödevleri ile ortak çalışma ve işbirliğine teşvik edilirler. - Bilgisayar laboratuvar uygulamlarıyla öğrencilerin biyoinformatik yöntemleri ve uygulamaları hakkında Ders süresi içerisinde pratik yapma imkanı bulması sağlanır. - Öğrencilerin modern yöntemlerle biyoinformatik iş akışlarını geliştirmeleri ve ortaklaşa çalışmaları sağlanır.
- Ders kitabı: Ismail, H.D., 2023. Bioinformatics: A Practical Guide to Next Generation Sequencing Data Analysis. Chapman and Hall/CRC. -Ders kitabı: Choudhuri, S., 2014. Bioinformatics for beginners: genes, genomes, molecular evolution, databases and analytical tools. Elsevier. - Unix Kabuk Programlama: https://www.gnu.org/software/bash/ - Python yorumlayıcı: https://www.python.org/ - Jupyter notebook: https://www.jupyter.org/ - R Studio: https://posit.co - Biopython: https://biopython.org - R-Bioconductor: https://www.bioconductor.org - Nextflow: https://www.nextflow.io - Kans, J., 2024. Entrez direct: E-utilities on the UNIX command line. In Entrez programming utilities help [Internet]. National Center for Biotechnology Information (US). - Chang, J., Chapman, B., Friedberg, I., Hamelryck, T., de Hoon, M., Cock, P., Antao, T., Talevich, E. and Wilczynski, B., 2010. Biopython tutorial and cookbook. Update, pp.15-19.