Atom ve Molekül Fiziği alanında doktora yapan öğrencilerin tez dönemlerinde kullanması muhtemel yapısal analizlerin genel bilgilerinin verilmesi ve çeşitli uygulamalarının gösterilerek bu alanda alt yapı oluşturulması amaçlanmaktadır.

Simülasyon teknikleri, Newton dinamiği, Topluluklar, Moleküller dinamik simülasyon programları, örnek hesaplamalar, simülasyon sonuçlarının değerlendirilmesi.

Sunumlar, literatür verilerinin işlenişinin incelenmesi için ders notları

Frenkel, D., Smit, B., Tobochnik, J., McKay, S. R., & Christian, W. (1997). Understanding molecular simulation. Computers in Physics, 11(4), 351-354. Rapaport, D. C. (2004). The art of molecular dynamics simulation. Cambridge university press.